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電子結(jié)構(gòu)分析【04】差分電荷密度和電荷布居要如何分析?要點(diǎn)在這里
來源: 時(shí)間:2022-12-16 17:46:22 瀏覽:14127次


測試狗模擬計(jì)算

差分電荷密度電荷布居分析放在一起講,是因?yàn)樗鼈兯治龅膶?duì)象是相似的,都是用來分析化學(xué)過程當(dāng)中電子轉(zhuǎn)移情況的。我們這次就從原理,求取過程,用途等方面來看看這兩類分析方法。


電子電荷密度

那么我們通過求解薛定諤方程得到的電子電荷密度,和體系實(shí)際的電荷密度之間是什么關(guān)系呢?首先,顯然我們計(jì)算電子電荷密度的時(shí)候沒有考慮帶正電的原子核。其次,我們解薛定諤方程的時(shí)候,常常解的是外層價(jià)電子的薛定諤方程,而將內(nèi)層電子當(dāng)作芯電子,不放在求解薛定諤方程的范圍。因此我們求解出來的電荷密度與體系實(shí)際的電荷密度是有差異的。好消息是,原子核與芯電子構(gòu)成的原子實(shí),在化學(xué)反應(yīng)的過程中變化很少。所以它們的存在對(duì)分析電子轉(zhuǎn)移的貢獻(xiàn)也就微乎其微。所以,對(duì)價(jià)電子的計(jì)算常常能夠很好地表征化學(xué)反應(yīng)中的電荷轉(zhuǎn)移現(xiàn)象。


差分電荷密度

有了電子電荷密度,我們首先來討論差分電荷密度。所為差分電荷密度,是指的一個(gè)體系經(jīng)過吸附或者替代之類的操作,這個(gè)操作后的電荷密度減去操作前的電荷密度得到的電荷密度分布差。為什么是吸附和替代呢?因?yàn)檫@兩個(gè)操作中,原子實(shí)的位置可以是不變的。

比如吸附,是吸附后的體系的電荷密度,減去吸附前的表面的電荷密度,減去吸附前的分子的電荷密度,不論是表面還是吸附分子都是不動(dòng)的(如果放開優(yōu)化,吸附的時(shí)候分子結(jié)構(gòu)和表面結(jié)構(gòu)都會(huì)有一定的結(jié)構(gòu)改變的,但是計(jì)算差分電荷密度的時(shí)候,要以吸附之后的構(gòu)型為基礎(chǔ),對(duì)表面和吸附分子做單點(diǎn)計(jì)算,以保持吸附前后構(gòu)型不變)。

替代也是一樣,把一個(gè)原子替代成另一個(gè)原子,所有的原子位置不變。這種情況下,帶原子核的位置不變,芯電子的分布也不會(huì)變,那么電荷分布的變化,就等于價(jià)電子分布的變化了。

差分電荷密度的切面填色圖和三維等值面 

圖1 差分電荷密度的切面填色圖和三維等值面

差分電荷密度有不同的可視化方式,可以對(duì)某個(gè)切面進(jìn)行填色圖的表示,也可以顯示為三維的等值面,如圖1,就是相同兩個(gè)系統(tǒng)的差分電荷密度圖的切面填色圖與三維等值面圖。左圖填色圖中,紅色代表電荷增加區(qū)域,藍(lán)色代表電荷減少區(qū)域,而右圖的三維等值面圖當(dāng)中,黃色代表電荷增加,淺藍(lán)色代表電荷減少。

我們使用差分電荷密度圖,常常是為了討論體系的成鍵狀況。比如圖1表示的是FeN4/C和N/C對(duì)COOH基團(tuán)的吸附的差分電荷密度圖。從左邊兩個(gè)切面填色圖來看,兩個(gè)吸附體系的吸附分子與表面之間都有電荷聚集,但是,兩個(gè)填色圖的色卡的比例尺不一樣,左圖最紅的地方電荷密度是0.02,有圖最紅的地方電荷密度是0.005,所以左邊FeN4/C吸附COOH基團(tuán)的系統(tǒng)在成鍵區(qū)域電子聚集得更多,所以吸附更加穩(wěn)固。


bader電荷布居

差分電荷密度可以一目了然地觀察一個(gè)化學(xué)過程的電荷轉(zhuǎn)移情況,但是,這種觀察是定性的,當(dāng)電荷增加區(qū)域和減少區(qū)域都有復(fù)雜的幾何形狀,并且纏繞在一起的時(shí)候,就很難從圖像中得出有意義的結(jié)論。所以有時(shí)候我們會(huì)使用定量的方法,統(tǒng)計(jì)每一個(gè)原子帶了多少電荷,這樣就可以更加確切地分析一個(gè)化學(xué)過程中原子的電荷轉(zhuǎn)移情況。這樣統(tǒng)計(jì)每個(gè)原子帶多少電荷的辦法,屬于電荷布居分析。電荷布居遠(yuǎn)不止bader電荷布居一種,還包括Mulliken布居,Lodwin布居,Hirshfield布居等等,統(tǒng)計(jì)的也不一定只是每個(gè)原子帶的電荷,還可能是每個(gè)原子軌道所帶的電子數(shù)。不過這里只介紹bader電荷布居。

bader電荷布居所依據(jù)的是電荷密度的零通量面。它的思路是,如何劃分原子之間的界限呢?我們知道,距離原子核越近,電子的密度越高,所以原子周圍電子密度會(huì)隨著遠(yuǎn)離原子核的方向下降,我們定義電子密度下降最快的方向就是電子密度下降的梯度方向。沿著電子密度下降梯度的方向運(yùn)動(dòng),電子密度就會(huì)一直下降。但是這個(gè)趨勢不會(huì)一直成立,如果空間里面不止一個(gè)原子的話。會(huì)存在一個(gè)分界面,越過了這個(gè)分界面,雖然距離A原子更遠(yuǎn)了,但是距離B原子更近,所以電子密度反而會(huì)升高。在這個(gè)分界面上,電子密度梯度是等于零的,這個(gè)分界面叫做電荷密度的零通量面。

每一個(gè)原子核周圍被零通量面包圍的區(qū)域,被bader電荷布居的方法劃定為這個(gè)原子的“勢力范圍”,將這個(gè)“勢力范圍”內(nèi)的電子積分起來得到的電子的數(shù)量,被統(tǒng)計(jì)為這個(gè)原子所帶的電子的數(shù)量,這種統(tǒng)計(jì)方法就是bader電荷布居。

一個(gè)常見的電荷布居表格

圖2 一個(gè)常見的電荷布居表格

電荷布居常常用表格來表示,有時(shí)候表示為每個(gè)原子的價(jià)電子數(shù),如圖二表格中的第一行數(shù)字,有時(shí)候則加上核電荷,表示為每個(gè)原子的總電荷數(shù),如圖二表格中的第二行數(shù)。

電荷布居常常用來判斷吸附過程中的電荷轉(zhuǎn)移,來解釋吸附作用的強(qiáng)弱。如果吸附過程中有明顯的電荷轉(zhuǎn)移,則吸附過程中表面與吸附分子有明顯的相互作用,吸附很可能會(huì)比較強(qiáng)。如果電荷轉(zhuǎn)移比較小,則可能相互作用比較弱,吸附也會(huì)比較弱。這兩點(diǎn)中后者是有反例的。比如兩個(gè)相同的氧原子或著兩個(gè)相同的氮原子,它們可以成很強(qiáng)的鍵,但由于他們的電負(fù)性是一樣的,所以之間沒有凈電荷轉(zhuǎn)移。所以,多數(shù)情況下,人們是用電子轉(zhuǎn)移較多的現(xiàn)象來推定吸附分子與表面之間有明顯的相互作用,而相反的結(jié)論則不可靠。


總結(jié)

以上介紹了差分電荷密度與bader電荷布居的一些知識(shí)。差分電荷密度與電荷布居都是以價(jià)電子的空間分布為基礎(chǔ)的,其中差分電荷密度的定義為,在一個(gè)原子核不動(dòng)的過程中,過程前后的電荷密度之差。bader電荷布居則是通過定義電荷密度的零通量面的方式定義每個(gè)原子所帶的電荷。bader電荷布居與差分電荷密度都可以用來分析一個(gè)過程中電荷轉(zhuǎn)移的情況,從而進(jìn)一步分析這個(gè)過程是否存在著化學(xué)意義上的相互作用。


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